西农科研团队真牛!circRNA研究二连发
10月Cell Death & Disease杂志、Journal of Cellular Physiology杂志分别在线发表了西北农林科技大学陈宏教授为通讯作者的2篇circRNA研究文章,分别介绍了circLMO7、circFUT10在调控牛成肌细胞发育中的作用。一起来看看这两篇文章的具体内容吧~
CircLMO7通过竞争性结合miR-378a-3p调控成肌细胞分化和存活
Circular RNA profiling reveals an abundant circLMO7 that regulates myoblasts differentiation and survival by sponging miR-378a-3p
研究内容:circRNA调控成肌细胞分化和存活
发表期刊:Cell Death & Disease
影响因子:5.965
本研究利用测序技术,共鉴定得到了12981个候选circRNAs,包括530个intronic circRNAs。研究发现一个亲本基因可能会产生多个circRNA亚型,但只有1或2个表达水平较高。大多数候选circRNA包含2~7个外显子,与back-splicing sites的基因组距离通常小于50kb。上游或下游侧翼内含子的长度通常小于105 nt(平均≈11000nt)。
利用qPCR方法验证了17个差异表达的circRNA,并对下调最显著的circLMO7进行分析。结果表明circLMO7能够吸附miR-378a-3p而解除其对靶基因HDAC4的抑制作用,进而调控成肌细胞的增殖与分化。过表达circLMO7后检测了miR-378a-3p靶基因HDAC4的表达水平,发现circLMO7显著增强HDAC4的表达。
图 circLMO7抑制牛原代成肌细胞的分化
CircFUT10通过竞争性结合miR-133a调控成肌细胞增殖和分化
CircFUT10 reduces proliferation and facilitates differentiation of myoblasts by sponging miR-133a
研究内容:circRNA调控成肌细胞增殖和分化
发表期刊:Journal of Cellular Physiology
影响因子:4.08
本研究基于上述文章的测序结果,通过对牛骨骼肌组织的circRNAs测序数据进行分析,进一步表征候选circRNA(circFUT10)在肌肉发育中的作用。
分析结果表明circFUT10在胚胎和成人骨骼肌组织中高度(但差异)表达。 circFUT10可以诱导牛原代成肌细胞分化,并增加MyoD,MyoG和MyhC在mRNA和蛋白水平的表达。 circFUT10增加了细胞周期中G0/G1期的成肌细胞数量,并降低了S期细胞的比例;此外,circFUT10可以抑制成肌细胞增殖并促进其凋亡。通过荧光素酶筛选实验,发现circFUT10上有3个miR-133a潜在的结合位点。研究结果表明,circFUT10通过竞争性结合miR-133a并抑制其活性来调节成肌细胞分化和细胞存活。
图 circFUT10对细胞凋亡的影响
参考文献
1. Wei XF,et al. (2017) Circular RNA profiling reveals an abundant circLMO7 that regulates myoblasts differentiation and survival by sponging miR-378a-3p. Cell Death and Disease . doi:10.1038/cddis.2017.541.
2.Li H, et al. (2017) CircFUT10 reduces proliferation and facilitates differentiation of myoblasts by sponging miR-133a. J Cell Physiol. doi: 10.1002/jcp.26230.
上述研究中的circRNA测序及数据挖掘由联川生物提供技术支持
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黄媛 编辑